太祖朱元璋应天称帝，传十六帝，至崇祯帝殉国凡二百七十七年；其后宗室南渡，别有南明诸政权。本页汇整帝系年号、学术史分期与大事记三栏。
甲申之变后，明宗室与遗臣相继于南方称帝抗清，各政权松散并立、互不统属，史称南明。
理学全面官学化。太祖定科举以程朱传注为宗，成祖敕修《四书大全》《五经大全》《性理大全》（1415）颁行天下，朱学定于一尊。学者多守朱子家法，薛瑄开「河东学派」笃实践履，吴与弼「崇仁之学」则已暗启心性一路。
由朱返陆、心学勃兴。陈献章「白沙之学」主静中养出端倪，开心学先声；湛若水倡「随处体认天理」。至王守仁龙场悟道，揭「致良知」「知行合一」，集心学之大成，王学风靡海内，遂与程朱并峙。
阳明后学分化，讲学结社之风极盛。浙中王畿主「四无」近于禅，泰州王艮倡「百姓日用即道」下及李贽之「童心说」，学风趋于活泼亦渐入狂禅。与此同时，藏书、考据、博物之实学暗自滋长。
针对王学末流之空疏，东林书院顾宪成、高攀龙讲学议政，复张「躬行」与气节。经世实学与西学并兴：徐光启、利玛窦译介西方历算，宋应星撰《天工开物》。刘宗周、黄宗羲承其绪而下启清初学风。
※ 分期框架参酌通行明代学术史叙述（程朱—心学—王学流衍—东林实学），起讫年取整以便记诵；学界尚有不同分段，可按研究口径调整。